В Ставропольском базовом медицинском колледже работает преподавателем фармакологии с 1997 года. Председатель цикловой медицинской комиссии общепрофессиональных дисциплин с 2002 года. Является одним из ведущих преподавателей общепрофессиональных дисциплин по подготовке студентов специальностей 34.02.01 Сестринское дело, 31.02.01 Лечебное дело, 31.02.02 Акушерское дело. В совершенстве владеет базовым компонентом содержания преподаваемого предмета. Эффективно использует разнообразные средства, методы и формы обучения. Обеспечивает оптимизацию учебного процесса и современный уровень преподавания, используя электронные обучающие ресурсы, в том числе образовательного портала колледжа: лекции, мультимедийные презентации, тестовые задания, ситуационные задачи, что способствует более глубокому освоению студентами предмета «Фармакология».

Еленой Николаевной разработаны и используются в образовательном процессе рабочие программы дисциплин, учебно-методические комплексы, включающие в себя теоретический и практический материал, фонд оценочных средств, электронные образовательные ресурсы. Данные материалы используют в работе все преподаватели цикловой методической комиссии. Кроме создания методического материала, преподаватель транслирует накопленный педагогический опыт посредством участия в открытых конференциях, занятиях, вебинарах, публикаций в периодической печати и интернет-ресурсах. Являясь председателем цикловой методической комиссии, Е.Н. Кривогубенко для всех преподавателей является наставником, поскольку организует и руководит их работой.

Преподаватель также является наставником и для студентов. Она курирует работу обучающихся по написанию докладов к студенческим конференциям, профессиональным конкурсам, олимпиадам, руководит научно-исследовательской работой, помогает подготовиться студентам к выступлениям на научных студенческих кружках и к защите индивидуальных проектов.

За многолетнюю плодотворную деятельность Кривогубенко Елена Николаевна неоднократно отмечалась почетными грамотами, благодарностями администрацией колледжа, города Ставрополя, министерствами здравоохранения Российской Федерации и Ставропольского края.